Однажды мне нужно было используя rsync скопировать с сервера много данных к которым имел доступ только root пользователь, по этому я разрешил подключение root пользователю по ssh.
По умолчанию в Ubuntu пользователь root не имеет пароля, по этому создадим его, если это не сделано ранее:
sudo passwd root
Потом откроем файл конфигурации SSH сервера в любом текстовом редакторе, например nano (CTRL+x для выхода):
sudo nano /etc/ssh/sshd_config
Найдем параметр PermitRootLogin и изменим на yes чтобы разрешить подключение root пользователем:
PermitRootLogin yes
Перезапустим ssh чтобы применить изменения:
service sshd restart
Смотрите также мои статьи:
Установка и настройка SSH
Подключение к SSH с использованием ключей
Администрирование пользователей Linux