Чтобы установить mcrypt в Ubuntu/Debian необходимо выполнить команду:
sudo apt-get install php-mcrypt
В CentOS так:
sudo yum install php-mcrypt
После этого в директории PHP появится файл mcrypt.ini подгружающий расширение mcrypt.so, в моем случае появился /etc/php/7.0/mods-available/mcrypt.ini.
Активировать/деактивировать модуль можно так:
sudo phpenmod mcrypt sudo phpdismod mcrypt
Перезапустим Apache2 чтобы применить изменения:
sudo service apache2 restart
Посмотрим активирован ли mcrypt:
php -i | grep -i mcrypt