Для удаления W3 Total Cache из WordPress нужно:
1) В меню плагина нажать кнопку очистки кеша.
2) Деактивировать плагин в меню плагинов и там же нажать «Удалить»
3) В корневой директории сайта, в начале файла wp-config.php, если остались, удалить строки:
/** Enable W3 Total Cache Edge Mode */
define('W3TC_EDGE_MODE', true); // Added by W3 Total Cache
/** Enable W3 Total Cache */
define('WP_CACHE', true); // Added by W3 Total Cache
4) Как я заметил после плагина остается много файлов, а на крупных сайтах могут остаться миллионы файлов с кешированными данными.
В директории wp-content удалим файлы, если они есть, advanced-cache.php, object-cache.php, директории w3tc-config и cache (здесь кешированные данные).
Все.